Detalhe da pesquisa
1.
MSNovelist: de novo structure generation from mass spectra.
Nat Methods
; 19(7): 865-870, 2022 07.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35637304
2.
Taxonomic classification of DNA sequences beyond sequence similarity using deep neural networks.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 119(35): e2122636119, 2022 08 30.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36018838
3.
Combining Experimental with Computational Infrared and Mass Spectra for High-Throughput Nontargeted Chemical Structure Identification.
Anal Chem
; 95(32): 11901-11907, 2023 08 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37540774
4.
Chemically informed analyses of metabolomics mass spectrometry data with Qemistree.
Nat Chem Biol
; 17(2): 146-151, 2021 02.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33199911
5.
Interpretation of the DOME Recommendations for Machine Learning in Proteomics and Metabolomics.
J Proteome Res
; 21(4): 1204-1207, 2022 04 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35119864
6.
Illuminating the dark metabolome of Pseudo-nitzschia-microbiome associations.
Environ Microbiol
; 24(11): 5408-5424, 2022 11.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36222155
7.
RepoRT: a comprehensive repository for small molecule retention times.
Nat Methods
; 21(2): 153-155, 2024 Feb.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38191934
8.
SIRIUS 4: a rapid tool for turning tandem mass spectra into metabolite structure information.
Nat Methods
; 16(4): 299-302, 2019 04.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30886413
9.
Critical assessment of chromatographic metadata in publicly available metabolomics data repositories.
Metabolomics
; 18(12): 97, 2022 11 27.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36436113
10.
Mass Difference Matching Unfolds Hidden Molecular Structures of Dissolved Organic Matter.
Environ Sci Technol
; 56(15): 11027-11040, 2022 08 02.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35834352
11.
Current status of retention time prediction in metabolite identification.
J Sep Sci
; 43(9-10): 1746-1754, 2020 May.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32144942
12.
Secondary ion mass spectrometry imaging and multivariate data analysis reveal co-aggregation patterns of Populus trichocarpa leaf surface compounds on a micrometer scale.
Plant J
; 93(1): 193-206, 2018 Jan.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-29117637
13.
Bayesian networks for mass spectrometric metabolite identification via molecular fingerprints.
Bioinformatics
; 34(13): i333-i340, 2018 07 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-29949965
14.
Liquid-chromatography retention order prediction for metabolite identification.
Bioinformatics
; 34(17): i875-i883, 2018 09 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30423079
15.
Correction: Gene Expansion Shapes Genome Architecture in the Human Pathogen Lichtheimia corymbifera: An Evolutionary Genomics Analysis in the Ancient Terrestrial Mucorales (Mucoromycotina).
PLoS Genet
; 12(12): e1006491, 2016 Dec.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-27918580
16.
Expanding the Use of Spectral Libraries in Proteomics.
J Proteome Res
; 17(12): 4051-4060, 2018 12 07.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30270626
17.
Bad Clade Deletion Supertrees: A Fast and Accurate Supertree Algorithm.
Mol Biol Evol
; 34(9): 2408-2421, 2017 09 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-28873954
18.
Mining molecular structure databases: Identification of small molecules based on fragmentation mass spectrometry data.
Mass Spectrom Rev
; 36(5): 624-633, 2017 09.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-26763615
19.
Finding approximate gene clusters with Gecko 3.
Nucleic Acids Res
; 44(20): 9600-9610, 2016 Nov 16.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-27679480
20.
Searching molecular structure databases with tandem mass spectra using CSI:FingerID.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 112(41): 12580-5, 2015 Oct 13.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-26392543